当前位置:>首页>体系研究成果

Nature突破:香蕉基因组测序

作者:中国香蕉资讯网 发表时间:2012-07-12
  生物通报道  由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序,并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。

  研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍体(doubled-haploid)Musa acuminata的基因组图。从生成的523Mb基因组序列草图中,他们继续开始探究植物的进化史和与其他植物的关系。   “参考芭蕉基因组序列代表了解开这一极其重要的农作物复杂的遗传学的一项重要进展,它的育种特别具有挑战性,”文章资深作者、法国国家科学研究中心、埃夫里大学及Genoscope中心成员Patrick Wincker说。研究人员将这一序列草图称之为“遗传改良香蕉的至关重要的踏脚石。”   Wincker和他的同事们解释说从7000年前香蕉驯化伊始,芭蕉物种与亚物种间就发生了多次的杂交。结合选择无需施肥、生成无籽果实的植物,这样的杂交促成了由M. acuminata和M. balbisiana基因组构成的二倍体和三倍体香蕉品种的形成。   在当前的研究中,研究人员将焦点放在了一种称为Pahang的双单倍体香蕉上,Pahang是通过培育来自malaccensis亚物种的野生M. acuminata而生成。他们解释说这种野生植物的单倍体基因组是在广泛种植的三倍体香蕉Cavendish中发现的三种Musa基因组之一,Cavendish的体细胞无性系占据了当前生产约一半的香蕉。   采用Roche 454 GS FLX和 Illumina GAIIx平台进行Sanger法测序和高通量鸟枪测序(shotgun sequencing),研究小组生成了覆盖约90% Pahang基因的组装草图。   随后分析这一序列组装揭示了36,542预计蛋白质编码基因和235种microRNAs。基因组中最显著的是转座子,占据了一半的序列。